2-Abz - 2-Aminobenzoyl, comhcheanglaíonn sé le 2,4-dinitrophenyl (Dnp) nó 3-nítri-tírosín (NitroTyr) chun péirí Fluorophore/Quencher a chruthú. excitation ag 320 nm, astú ag 420 nm.
3-Is féidir abz (aigéad m-aimínibeinseach) a fheiceáil mar -aimínaigéad. Nuair a ionchorpraítear aigéad m-aminobenzoic i slabhraí peptide, bíonn cas docht mar thoradh air.
4-Is féidir Abz (aigéad p-Aminobenzoic, PABA), ar díorthach aigéad beansóch a tharlaíonn go nádúrtha é, a úsáid freisin mar spásálaí líneach docht.
Is díorthach aimínaigéad é Abu, L- -Aminobutyryl ((S)-2-Aimín-bhútanail), -aigéad aimínabhúitrileach. Mar gheall ar a chosúlacht struchtúrach le aimínaigéid nádúrtha, is minic a úsáidtear é i ndearadh agus sintéis peptídí agus mimetics peptide.
Léiríonn Ac aicéitil. Is modhnú cobhsaithe coiteann do pheptídí sa nádúr é acetylation N-terminal.
Is féidir Acm, Acetamidomethyl, a bhaint as Hg(II) nó Ag(I). Tá sé ar cheann de na grúpaí cosanta thiol a úsáidtear go coitianta le haghaidh cistéin nuair a bhíonn peiptídí á shintéisiú le bannaí disulfide iolracha.
Is hormone é ACTH (hormón adrenocorticotrópach) atá secreted ag an pituitary anterior a spreagann an cortex adrenal chun corticosteroids a tháirgeadh.
Is aimínaigéad neamhphróitéinigineach é aad (L- -aigéad aimínaidipeach). Tá a struchtúr cosúil le haigéad glútamach (Glu), le grúpa meitiléine breise ina thaobh-shlabhra.
(2-Aminoethocsa)aigéad aicéiteach, ar a dtugtar freisin eistear eitile glicín nó glycine eitile, is féidir é a úsáid mar spacer nó nascóir i sintéis modhnú peptide.
Is féidir 1-(1'-adamantyl)-1-meitil-ethocsacarbóinile, grúpa cosanta aimín an-subile-aigéad i sintéis peiptíde, a dhíchosaint le 3% TFA/CH2Cl2
Is comhdhúil fluaraiseach é AFC (7-Aimín-4-trifluoromethylcoumarin) a bhfuil sceith ar an gcúmarín a scaoiltear ag 395-400 nm, astú ag 495-505 nm.
Cruthaítear speicis meáchan móilíneach níos airde mar gheall ar greamaitheacht neamhchomhfhiúsach speiceas níos lú. I bpróitéiní go háirithe, is cineál dínádúraithe é comhiomlánú a d'fhéadfadh tarlú ar dhromchlaí neamhpholacha le struchtúir thánaisteacha, mar iad siúd a chruthaíonn idirghníomhaíochtaí ionmhóilíneacha go hiondúil agus a chuirtear i leatháin agus i leatháin na próitéine. Idirghníomhaíonn móilíní lena chéile, uaireanta foirmíonn siad foirmeacha polaimóilíneacha dothuaslagtha. Tá comhiomlánú i gcodarsnacht le oligomerization, gnáth-idirghníomhaíocht próitéiní dúchasacha fillte i gceart chun polaiméirí ard-ord a fhoirmiú.
AHX, Aminohexanoyl,6-aigéad heicseanóch aimín, giorraithe freisin Aca nó LC, De ghnáth tugadh isteach mar spásálaí gearr neamhpholacha idir biotin, fluairafóir agus seichimh pheptíde.
2-Is aimínaigéad neamhphróitéin neamh-phróitéin é aigéad aimínoisóbutyric ar táirge deiridh é de mheitibileacht phirimidín agus a eisfhearadh san fhual agus atá i láthair i roinnt antaibheathaigh de bhunús fungasach. Úsáidtear freisin chun aimínaigéid nádúrtha a chur in ionad sintéise peptide.
Is éard atá i n-alcóil na comhdhúile orgánacha sin arb iad is sainairíonna iad grúpa hiodrocsaile amháin, dhá cheann nó níos mó (−OH) atá ceangailte leis an adamh carbóin i ngrúpa ailcile nó i slabhra hidreacarbóin. Is comhdhúile ríthábhachtacha cliniciúla iad alcóil peptide nach ndéantar dóthain imscrúduithe orthu sna staidéir ar an gcaidreamh struchtúr-ghníomhaíochta (SAR) maidir le fionnachtain drugaí. Mar shampla, is gníomhaí gabhdóra opioid é DAMGO arna mhodhnú ag alcól ag an gcríochfort C, leis an seicheamh Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Tá roghnaíocht agus cleamhnas ard aige don receptor μ-opioid.
Is comhdhúil orgánach é aildéad ina bhfuil an grúpa carbónil ceangailte d'adamh carbóin ag deireadh slabhra carbóin. Is uirlisí tábhachtacha iad aildéid peptide sa bhithcheimic agus sa bhitheolaíocht cheimiceach chun proteases a chosc agus a dhíchumasú go ceimiceach.
Aloc - Allyloxycarbonyl, grúpa cosanta aimín (giorraithe freisin Alloc). Is féidir cosaint a bhaint le Pd(PPh3)4.
Tagann galar Alzheimer, marcáilte le plaiceanna -amyloid agus tau tangles, as mífheidhmiú synaptic agus saincheisteanna cosán imréitigh, rud is cúis le lagú cognaíocha.
7-Aimín-4-Is taiscéalaí fluaraiseachta coitianta é aimínaigéad le haghaidh lipéadú peiptíde i staidéir próitéáis. Múchann a chomhchuingeach le peptide an comhartha fluaraiseacha, agus is féidir leis an AMC a scaoiltear nuair a scoilttear próitéas gníomhaíocht einsíme a chainníochtú, le huasmhéadú excitation/astaithe de 345/445 nm. Mar shampla, an tsubstráit roghnaithe peptide fluaraiseacha chun a chinneadh an ghníomhaíocht trypsin-mhaith proteasome íonaithe, leis an seicheamh: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.
Peptíd natríuretic atriail (ANP), hormone a tháirgtear agus a scaoiltear ag atria an chroí mar fhreagra ar líon agus brú fola méadaithe. Feidhmíonn sé cothromaíocht sreabhán agus brú fola a rialáil trí vasodilation a chur chun cinn, táirgeadh fual a mhéadú (diuresis), agus ath-ionsú sóidiam sna duáin a laghdú. Cuidíonn na gníomhartha seo le cur in aghaidh éifeachtaí brú fola ard agus ró-ualach sreabhán sa chorp.
Is seichimh ghearr aimínaigéad iad peptídí antaigineacha a dhíorthaítear ó phróitéiní nó ó bhithmhóilíní eile a spreagann freagairt imdhíonachta orgánach. Aithníonn an córas imdhíonachta na peptides seo mar rud eachtrach nó eachtrach don chomhlacht, rud a fhágann go gcuirtear cealla imdhíonachta ar nós cealla T agus cealla B i ngníomh. Tá ról ríthábhachtach ag peptídí antigenic i bhfreagraí imdhíonachta, lena n-áirítear táirgeadh antasubstainte oiriúnaitheach agus forbairt cuimhne imdhíonachta. Déantar staidéar forleathan orthu san imdhíoneolaíocht agus i bhforbairt vacsaíní mar gheall ar a gcumas freagairtí imdhíonachta sonracha a spreagadh i gcoinne pataiginí nó cealla neamhghnácha.
Peptíde brainseach neamhshiméadrach
Is féidir sintéis peptídí neamhshiméadracha le 2, 4, agus 8 brainse a bhaint amach trí lísín, arginine, nó aigéad glútamach a chur isteach go straitéiseach sa seicheamh peptíde.
démheitiolarginín neamhshiméadrach (ADMA)
Is comhdhúil cheimiceach a tharlaíonn go nádúrtha é démheitiolarginine neamhshiméadrach (ADMA, Arg(Me)2) agus coscaire inghineach ar ocsaíd nítreach synthase (NOS). Is féidir Fmoc-Arg(Me)2-OH (neamhshiméadrach) a úsáid go díreach chun peiptídí a bhfuil démheitiolarginín neamhshiméadrach iontu a shintéisiú.
5-Is féidir aigéad aimínvaleric, a úsáid mar spásálaí nó mar nascóir i sintéis modhnuithe peptíde.
Is grúpa cosanta imidazole aigéad-labile é Benzyloxymethyl (Bom) a úsáidtear i bpróiseas Boc-SPPS le haghaidh peiptídí ina bhfuil histidine. Táirgeann benzyloxymethyl formaildéad an-imoibríoch tar éis cóireála le haigéad. Dá bhrí sin, is é Bom an scoilteadh is fearr i láthair Cys, methoxyamine nó comhdhúile eile a imoibríonn le aildéid.
Tá aimínghrúpa ag -aimínaigéid ceangailte leis an -charbón, arb é an dara adamh carbóin é atá ar shiúl ón ngrúpa carbocsail. Is féidir an fhoirmle struchtúrach ghinearálta d’aimínaigéad a léiriú mar: R−CH(NH2)–COOH
Peptíd natríuretic de chineál B (BNP), hormone a tháirgtear go príomha ag ventricles an chroí mar fhreagra ar shíneadh iomarcach cealla matán croí. Tá ról ríthábhachtach aige maidir le brú fola agus cothromaíocht sreabhach a rialáil, go príomha trí vasodilation a chur chun cinn agus eisfhearadh sóidiam a mhéadú trí na duáin.
Is grúpa cosanta an-aigéad-labilea-aimín é t-Butyloxycarbonyl (Boc) i sintéis peptíde, is féidir é a scoilt le clóiríd TFA/meitiléine (1:1), HCl in aicéatáit eitile nó dé-ocsán, aigéad formach 98%.
2-(4-Défheinile)isopropiloxycarbonyl (Bpoc) is grúpa cosanta an-aigéad-labilea-aimín i sintéis peptíde, is féidir a scoilteadh le 1% TFA/clóiríd meitiléine.
Is féidir peptides le 2, 4, agus 8 brainsí a bhaint amach trí lísín, arginine, nó aigéad glútamach a chur isteach sa seicheamh peptíde.
Is grúpa cosanta hiodrocsaile é t-Butyldimethylsilyl (TBS nó TBDMS) atá comhoiriúnach le Fmoc-SPPS. Is aigéad-labile é agus is féidir iain fluairíde a scoilt go roghnach.
Is grúpa acyl é Benzoyl a thugtar isteach go minic ag críochfort N na peptides. Tá sé níos lú polar ná aicéitil (Ac) agus is féidir é a bheith mar mhodhnú buan.
Benzyl (Bzl) iarmhair ailcile agus grúpa cosanta taobh-shlabhra a úsáidtear chun alcóil a bhlocáil (Ser, Thr, Hyp) i sintéis peptide. is féidir é a scoilt le aigéid láidre nó le hidriginalú catalaíoch (eg hidrigin/Pd).
Is hormón peptide é cholecystokinin (CCK) a tháirgtear ag mucóis an intestine uachtarach agus a fhaightear sa lárchóras néaróg. Spreagann sé crapadh gallbladder, scaoileadh einsím pancreatic, agus bíonn tionchar aige ar phróisis gastrointestinal éagsúla.
Is peptide aimínaigéad 37- é peptide a bhaineann le géine calcitonin (CGRP) a bhaineann le calcitonin, amylin, agus adrenomedullin. Tá sé ann i dhá fhoirm, -CGRP (CGRP I) agus -CGRP (CGRP II), le gníomhaíochtaí bitheolaíocha den chineál céanna. Faightear CGRP go príomha i néaróin céadfacha agus lárnacha, a mbíonn tionchar acu ar fheidhm chardashoithíoch, meitibileacht chailciam, agus ton soithíoch fetoplacental. Tá a chuid gabhdóirí ceangailte le próitéin G agus gníomhaíonn siad cyclase adenylate, ag idirghníomhú le gníomhaíocht gabhdóirí a mhodhnaíonn próitéiní (RAMPanna) le haghaidh sainiúlacht ligand agus gáinneáil cheallacha.
Is analóg aimínaigéad neamhpholach é L-Cyclohexylalanine (Cha) de feiniolalainín, áit a gcuirtear fáinne cyclohexane in ionad an fháinne aramatacha. Ligeann an t-ionadú seo staidéar a dhéanamh ar ról na n-aimínaigéid aramatacha in idirghníomhaíochtaí ar nós idirghníomhaíochtaí π-π trí Cha i dturgnaimh a chur in ionad iarmhair feiniolalainín.
L- -Is aimínaigéad neamhpholach é ciclohexylglycine (Chg) a gcuirtear bac steiriúil air. Feidhmíonn sé mar idirmheánach cógaisíochta suntasach agus tá sé le fáil freisin i dtáirgí nádúrtha.
Táirgeann an t-ae agus cealla eile sa chorp colaistéaról go nádúrtha, ach is féidir leis teacht freisin ón mbia a ithimid, go háirithe ó tháirgí ainmhithe cosúil le feoil, éanlaith chlóis, agus táirgí déiríochta lán-saill. Is féidir colaistéaról a nascadh le peptides chun feabhas a chur ar chógaschinéitic.
cis-Hidroxyproline, an steiré-isiméir de thras-hiodrocsaiproline nádúrtha.
Tá citrulline i láthair i bpróitéiní mar thoradh ar mhodhnú einsímeach iar-aistritheach ar iarmhair arginine.
Is inhibitor kinase RSK2 é CMK le cumas comhchosúil ach níos lú cobhsaíochta ceimiceach ná FMK.
Is peptide natriuretic C-cineál (CNP) peptide ag cealla endothelial soithíoch, eol do chuid éifeachtaí vasodilatory. Léiríonn sé cosúlachtaí struchtúracha agus fiseolaíocha le peiptídí natríuretic atriail agus inchinne (ANP agus BNP).
L- -Is aimínaigéad neamhpholach é ciclopentylglycyl (Cpg) a gcuirtear bac steiriúil air.
I seicheamh peptíde, an t-iarmhar uathúil sin atá ceangailte leis an seicheamh líneach ag a ghrúpa aimín, é a fhágáil le grúpa carboxile saor in aisce.Is féidir an grúpa carboxyl iarmhar modhnuithe a dhéanamh ar nós amúchadh nó, i gcásanna cosúil le pyroglutamate, lachtadh inmheánach.
Is dath ciainín dearg-fluaraiseach é Ciainín 3 a sceitear go coitianta le foinse solais timpeall 558 nm agus astaithe solais ag thart ar 572 nm.
Is fluarafór dath ciainín é Ciainín 5 a astaíonn fluaraiseacht gar-infridhearg a sceitear go coitianta ó fhoinse solais timpeall 646 nm agus astaithe solais ag thart ar 664 nm.
Is aigéad ,ω-dé-aimín é aigéad L- , -Diaminobutyric, analóg níos giorra de ornithín (Orn) agus lísín (Lys). Le cosaint chuí, is féidir ω-daimínaigéid a mhodhnú go roghnach ag a suíomh Nω nó a ionchorprú chun peptídí brainseach nó dendrimers a chruthú.
Is crómasóir é 3-(Dimethylaminoazo)beinséin-4-aigéad carbocsaileach, atá nasctha le grúpaí aimín a úsáidtear i bhfeidhmeanna bithcheimice agus bitheolaíochta móilíneacha mar mhúchadh in aistriú fuinnimh athshondais fhluaraiseachta (FRET), m.sh. le EDANS. Excitation DABCYL ag 454 nm.
Clóiríd dabsyl ,4-démheitiolaimínbheinséinsulfónail, Crómafór atá nasctha le aimínghrúpaí a úsáidtear mar quencher i dteannta a chéile, m.sh. le EDANS. Excitation Dabsyl ag 436 nm.
4-Démheitiolaimín-1-naphthalene-sulfonyl, fluarafar atá nasctha le grúpaí aimín, excitation ag 342 nm, astaíocht ag 562 nm.
Is aigéad ω-dé-aimín é L- , -Diaminopropionic (Dap nó Dpr), atá ina analóg níos giorra d'aigéad diaminobutyric (Dab), ornithine (Orn), agus lísín (Lys). Is féidir díorthaigh mhodhnaithe ,ω-dé-aimínaigéid a athrú go roghnach ag a suíomh Nω nó a ionchorprú chun peiptídí brainseach nó dendrimers a chruthú.
Is grúpa aimínchosanta é 1-(4,4-Démheitiol-2,6-dé-ocsaiccliheacs-1-ilidene)ethyl (Dde) a úsáidtear i sintéis peiptíde. Is féidir é a scoilteadh go roghnach ag baint úsáide as hiodráit hiodraisín 2% i démheitiolformaimíd (DMF). Ceadaíonn Nω-Dde go bhféadfaí Dde a bhaint go sonrach ó aimínaigéid mar Dap, Dab, Orn, nó Lys tar éis sintéis peptide soladach-chéim Fmoc (SPPS), ag éascú modhnú ar-roisín ar an ngrúpa Nω-aimín.
Is bannaí comhfhiúsacha iad bannaí disulfíde a fhoirmítear idir dhá ghrúpa sulfhydryl (-SH) d’iarmhair chistéin i bpróitéiní.
2,4-Is grúpa cosanta formamide aigéad-labile é dimethoxybenzyl a úsáidtear le haghaidh modhnú cnámh droma inchúlaithe i sintéis peiptíde. Tá siad ionchorpraithe le linn sintéise peptide soladach-chéim (SPPS) mar an aimínaigéad nó dipeptide Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), áit a gcuireann Fmoc cosc ar chomhiomlánú peptide agus dá bhrí sin cuireann sé fadú éifeachtach chun cinn. Cuireann Dmb imoibrithe ciorclaithe chun cinn freisin agus cuireann sé cosc ar fhoirmiú asparagimide. Murab ionann agus díorthaigh Hmb, ní fhoirmíonn Dmb benzoxazepíní le linn gníomhachtaithe.
2,4-Is crómafór é diinitrophenyl atá comhchuingeach le aimínghrúpaí, a úsáidtear go coitianta mar mhúchadh i bhfoshraitheanna aistrithe fuinnimh athshondais fhluaraiseachta (FRET).
Is grúpa cosanta carboxamide aigéad-labile é 4,4′-Dimethoxydityl, ar a dtugtar bis-(4-methoxyphenyl)methyl) atá comhoiriúnach le sintéis peptide soladach-chéim Fmoc (SPPS).
Tá DOPA, 3,4-dihydroxyphenylalanine, ina réamhtheachtaí do roinnt néar-tharchuradóirí ríthábhachtacha, lena n-áirítear dopamine, norepinephrine, agus epinephrine.
(4,7, 10-Tricarboxymethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecyl)-aigéad aicéiteach, arna ghiorrú mar DOTA, ina chelator timthriallach atá ceangailte go hiondúil le N-críochfort na peptídí. Éascaíonn DOTA lipéadú peptídí le radanúiclídí cosúil le 68Ga nó 90Y le haghaidh feidhmeanna bithleighis éagsúla, lena n-áirítear íomháú agus teiripe spriocdhírithe.
Diphenylmethyl (dityl), grúpa cosanta aigéad-labile N-, O-, agus S.
Is oibreán úsáideach ceilteach é aigéad dieitiletriaminepentaaicéiteach (DTPA) do radanúiclídí amhail (68) Ga, (99m)Tc agus (111)In, atá infheidhme maidir le híomháú leigheas núicléach.
Is fluarafór é 5-[(2-aimínáitil)aimín)naftailéin-1-aigéad sulfónach (EDANS) a nasctar go coitianta le Nω na n-aigéad déimín cosúil le lísín. Úsáidtear go minic é i bhfoshraitheanna FRET, péireáilte go hiondúil le múchadh mar DABCYL. Tá tonnfhad excitation de 340 nm ag EDANS agus astaíonn sé ag 490 nm.
Polaipeiptíde gníomhachtú monocyte endothelial.
Úsáidtear eitile, grúpa ailcile agus homalóg meitile (Me), le haghaidh modhnuithe buan N- agus S-eitiliation i peptídí.
Teicníc is ea léarscáiliú epitóp (mapáil antaigin epitope) a úsáidtear chun na réimsí sonracha (is é sin, eipitíopaí antaigin) ar antaigin ar féidir antasubstaintí nó an córas imdhíonachta a aithint. Is féidir epitopes antigen a roinnt ina epitopes líneacha agus epitopes comhfhoirmiúil. Trí mhapáil antigen epitope, is féidir linn a thuiscint go domhain ar an gcaidreamh idir struchtúr agus feidhm an antigen, a bhfuil tábhacht mhór aige i bhforbairt vacsaíní, diagnóis galair, imdhíonteiripe agus gnéithe eile.
I measc roinnt modhanna mapála epitope antigen a úsáidtear go coitianta tá:
Criostalagrafaíocht X-gha: Is féidir leis anailís dhíreach a dhéanamh ar struchtúr tríthoiseach an antigen, rud a chinnfidh suíomh an epitope.
Athshondas maighnéadach núicléach: Is féidir é a úsáid freisin chun struchtúr an antigen a anailísiú chun an epitope a chinneadh.
Teicníc scanadh peptide: Ag baint úsáide as sraith de mhíreanna peiptíde sintéiseacha forluiteacha chun an epitope a cheanglaíonn an antashubstaint a aithint.
Mar shampla, i dtaighde agus i bhforbairt vacsaíní, cabhraíonn soiléiriú na bpríomheipitíopaí ar an antigen le vacsaíní níos éifeachtaí a dhearadh agus le freagairt imdhíonachta níos spriocdhírithe a spreagadh; i ndiagnóis galair, is féidir imoibrithe diagnóiseacha níos cruinne a fhorbairt nuair a chinntear na epitopes antigen a bhaineann le galair shonracha.
5-Is fluarafór é FAM (5-Carboxyfluorescein) a úsáidtear go coitianta chun bithmhóilíní a lipéadú, le tonnfhad excitation de 490 nm agus astú ag 520 nm.
Is fluarafór é fluaraiséin-6-carbóinile atá ceangailte d’aimínghrúpaí, le tonnfhad excitation de 490 nm agus astú ag 520 nm.
Is fluorophore é fluorescein isothiocyanate (FITC) a imoibríonn le grúpaí aimín. Nuair a bhíonn peptide á chlibeáil ag a N-críochfort le FITC, is gnách spásálaí cosúil le -alanín nó Ahx a chur isteach. Tá tonnfhad excitation de 490 nm ag FITC agus astaíochtaí ag 520 nm.
9-Is grúpa cosanta bonnlipile é fluorenylmethyl a úsáidtear chun O- agus S-chosaint.
Is coscaire do-aisiompaithe de RSK2 kinase é FMK, cetóin fluoromethyl.
9-Is féidir fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), an grúpa cosanta aimín i sintéis phas soladach FMOC, a bhaint le 20% piperidine/DMF.
Is grúpa cosanta indole é Formyl a úsáidtear i Boc-SPPS. Scoilteann HF Trp(For) i láthair mercaptan nó ag bunanna ar nós piperidine.
Is éard atá i gceist le haistriú fuinnimh athshondais fhluaraiseachta (FRET) an fuinneamh neamhradiative a aistriú ó fhluaraiféar sceitimíneach (deontóir) go glacadóir oiriúnach (múchadh). Braitheann an t-aistriú ar achar, treoshuíomh dépholach, agus forluí speictreach an deontóra agus an ghlacadóra. I bhfoshraitheanna FRET, nasctar an fluarafór agus an múchadh trí shlabhra peiptíde. Méadaíonn scoilteacht einsímeach an fhluaraiseacht trí dheontóir agus glacadóir a scaradh.
Is é fluaraiseacht an solas a astaíonn substaint a ionsúnn solas nó radaíocht leictreamaighnéadach eile. Tarlaíonn sé seo nuair a ionsúnn móilíní ar a dtugtar fluarafór fótóin de thonnfhad ar leith, nuair a éiríonn siad sceitimíní, agus ansin scaoileann siad fótóin agus filleann siad ar a mbunstaid. De ghnáth bíonn tonnfhad níos faide ag an solas a astaítear agus fuinneamh níos ísle ná an solas a shúitear isteach, rud a fhágann go mbíonn speictream fluaraiseachta sainiúil ann. Úsáidtear an feiniméan seo go forleathan chun críocha éagsúla eolaíocha agus leighis, lena n-áirítear micreascópacht, cítoiméadracht sreafa, agus speictreascópacht fhluaraiseachta.
Baineann polypeptide coisctheach gastric (GIP), ar a dtugtar peptide inslinotrópach atá ag brath ar ghlúcós, leis an teaghlach secretin hormóin. Spreagann sé secretion insulin, cuireann sé bac ar secretion aigéad gastrach, agus tá ról ríthábhachtach aige maidir le secretion insulin agus homeostasis glúcóis a rialáil.
L- -Déantar aigéad carbocsa-ghlútamach (Gla) a fhoirmiú trí charbocsalúchán iar-aistritheach d'aigéad glútamach, rud a fhágann go bhfuil próitéiní in ann iain chailciam a cheangal, amhail oistéacalcin. Déantar peptidí ina bhfuil gla a shintéisiú go hidéalach trí úsáid a bhaint as sintéis peptide soladach-chéim Fmoc (SPPS), toisc gur féidir le Gla dul faoi dhícharbocsaile chun aigéad glútamach a tháirgeadh i láthair aigéid láidre.
Tá peptides cosúil le glucagon ina mbaill den superteaghlach glucagon de hormóin peptide a dhíorthaítear ó réigiún C-críochfort an proglucagon. Déantar iad a shintéisiú go príomha ag cealla L intestinal.
Is hormón decapeptide é hormón a scaoileann gonadotropin (LHRH) a tháirgtear i gcealla néaróiscretory hypothalamic agus a scaoiltear i bpléascanna bíogacha isteach sa scaipeadh tairseach pituitary. Tá secretion Pulsatile ríthábhachtach d'fheidhmeanna atáirgthe, d'fhorbairt ghnéasach, agus difreáil.
Is hormón peptide hypothalamic é hormón a scaoileann hormóin fáis (GHRH), ar a dtugtar somatorelin freisin, a spreagann an gland pituitary chun hormón fáis a scaoileadh agus a shintéisiú.
Is hormón peptide hypothalamic é hormón a scaoileann hormóin fáis (GHRH), ar a dtugtar somatorelin freisin, a spreagann an gland pituitary chun hormón fáis a scaoileadh agus a shintéisiú.
Tagraíonn antigen leukocyte daonna (HLA) do ghrúpa próitéiní a fhaightear ar dhromchla cealla a bhfuil ról ríthábhachtach acu in aitheantas an chórais imdhíonachta ar shubstaintí eachtracha. Tá siad ionchódaithe ag na géinte móra coimpléasc histo-chomhoiriúnachta (MHC) i ndaoine agus tá siad riachtanach chun antaiginí a chur i láthair do chealla T, rud a chuireann ar chumas an chórais imdhíonachta idirdhealú a dhéanamh idir féinchealla agus cealla neamhfhéin. Tá na móilíní HLA an-ilghnéitheach agus ilmhorfach, ag cur go mór le freagairtí imdhíonachta aonair agus so-ghabhálacht i leith galair uath-imdhíonachta agus diúltú trasphlandúcháin.
2-hiodrocsa-4-Is grúpa cosanta foirmimíde aigéad-labile a úsáidtear le haghaidh modhnú cnámh droma inchúlaithe i sintéis peiptíde é meatocsabenzyl. Tá sé ionchorpraithe mar aimínaigéad nó Fmoc-Hmb dipeptide (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) le linn sintéise peptide Fmoc soladach-chéim (SPPS), a choscann comhiomlánú agus a chumasú síneadh peptide éifeachtach. Cuidíonn Hmb freisin le frithghníomhartha ciorclaithe agus cuireann sé cosc ar fhoirmiú asparagine.
Is homologue de L-arginine é L-Homoarginine, giorraithe mar Har, agus is féidir é a fháil i plasma agus fual. Tá Homoarginine mar thoradh ar ghuanidíniú lísín, is féidir a dhéanamh freisin ar pheptídí agus próitéiní.
Is homolog de L-citrulline é Homocitrulline, giorraithe mar Hci, agus is féidir é a bhrath i bhfual daonna.
Is homalóg cistéin é L-homocysteine, giorraithe mar Hcy, agus déantar é a tháirgeadh trí dhímheitiolú meitiainín. Is fachtóir riosca iad leibhéil Hcy fola ardaithe do ghalair cardashoithíoch agus néar-mheathlúcháin. I gcodarsnacht le díorthaigh Cys, ní dhéanann díorthaigh Hcy racemize le linn cúplála, ná -elimin.
Homalóga L-leucine, giorraithe mar Hle.
Is comhpháirt de choscóirí ACE agus renin é homophenylalanine, homologue feiniolalainín, arna ghiorrú mar Hph. Is druga frith-athlastach féideartha é Fmoc-Homophe-OH.
L-homoproline nó aigéad L-picolic, arna ghiorrú mar Pip nó Hpr. Is táirge díghrádaithe L-lísín é homalóg proline Hpr. Is féidir an dá enantiomers a bhrath i bplasma daonna. Ós rud é go mbíonn tionchar láidir ag iarmhair proline ar chomhfhoirmiú an pheptíde, is féidir a struchtúr tánaisteach a mhodhnú trí Hpr (nó aigéad carbocsile (Aze)) a chur in ionad Pro le HPr.
Déantar L-transhydroxyproline a tháirgeadh go hiar-aistrithe trí ocsaídiú proline. Is cuid mhór de phróitéin na collaigine agus na ndiúilicíní é hyp.
Is -aimínaigéad é isoserine, isiméir de L-serine.
Is féidir ivDde, grúpa cosanta aimín, a dhíchosaint agus a scoilt le hiodráit hiodraisín 2% i DMF. Tá ivDde níos seasmhaí ná Dde le cóireálacha iolracha piperidine le linn Fmoc-SPPS. Is féidir Nω-ivDde a bhaint go roghnach ó Dap, Dab Orn, nó Lys, rud a cheadaíonn modhnú iar-shintéiseach ar roisín ar an ngrúpa Nω-aimín.
Is miotallopróitéin multisubunit mór a iompraíonn ocsaigine é hemocyanin bearpholl eochrach (KLH) a aimsítear i haemailimpeach an haemocyanin bhairille ollmhór poll eochrach. Mar iompróir antigen, de ghnáth feabhsaíonn KLH cumais imdhíon-ghineachta agus socraithe antigen trí chúpláil seichimh spriocpholaiptíde, ag cur go mór giniúint antasubstaintí éifeachtacha, sonracha agus feidhmiúla chun cinn.
Is hormón decapeptide é hormón a scaoileann hormón luteinizing (LHRH nó GnRH) a shintéisítear ag cealla néaróiscretory laistigh den hypothalamus agus a scaoiltear isteach sa scaipeadh tairseach pituitary go pulsatile. Tá secretion Pulsatile ríthábhachtach don fheidhm atáirgthe, d'fhorbairt ghnéasach agus difreáil.
I ndearadh agus sintéis peptide, is féidir le taiscéalaithe nascóir a chur isteach idir an biotin nó an fluaraiseacha agus na peptides. Is é atá i spásálaí hidreafóbach coitianta ná aigéad aimínheacsanóch (Ahx), agus spásaire hidreafail choiteann is ea glycol polai(eitiléin) (PEG).
Próiseas reoite-thriomú, a bhaintear leacht as ábhair teas-íogair. Déantar an t-ábhar a reoite, a chur faoi fholús ard, agus a choinneáil ag teocht íseal. Cruthaíonn an brú a chruthaíonn an fholús go n-athraíonn an t-oighear ó staid sholadach go stát gásach gan dul tríd an stát leachtach. De ghnáth seachadtar peptides mar phúdar lyophilized.
Is teicníocht anailíse ildánach í Crómatagrafaíocht Leachtach-Speictriméadracht Aifrinn a chomhtháthaíonn crómatagrafaíocht leachta le mais-speictriméadracht chun faisnéis mhionsonraithe a sholáthar faoi chomhdhéanamh agus struchtúr móilíní laistigh de shamplaí casta.
Il Peptides Antigenic. Is bealach cumhachtach amháin é Il-peptide Antaigineach chun antasubstaintí frith-peiptíde ardleibhéil agus vacsaíní peiptíde sintéiseacha a tháirgeadh.
Teicníc anailíse is ea Mais-speictriméadracht Dí-asú/Ianaithe Léasair le Cúnamh Maitrís (MALDI-MS) a úsáidtear chun cóimheas mais-le-lucht na n-ian a thomhas. Tá sé an-úsáideach chun anailís a dhéanamh ar bhithmhóilíní cosúil le peiptídí, próitéiní agus polaiméirí.
Teicníc chumhachtach anailíse is ea mais-speictriméadracht (MS) a úsáidtear chun cóimheas mais-go-lucht (m/z) na n-ian a thomhas.
Is fluarafór é 4-Methocsa- -naphthylamide, arna ghiorrú mar MNA, a cheanglaítear de ghnáth le foshraith charbocsaiptíse ag an gcríochfort C. Scoilte 4M NA sceitimíní ag 335-350 nm agus astaíonn ag 410-440 nm
Is grúpa cosanta guanidyl é Methoxybenzenesulfonyl (Mbs) a úsáidtear i sintéis peptide soladach-chéim Boc (Boc-SPPS). Is féidir an grúpa cosanta seo a dhíchosaint trí scoilteacht le fluairíd hidrigine (HF).
4-Is grúpa cosanta sulfhydryl é Methylbenzyl (Mbzl) a úsáidtear i sintéis peiptíde soladach-chéim Boc-bhunaithe (Boc-SPPS). Tá Mbzl níos cobhsaí ná methoxybenzyl (Mob) faoi chóireáil aigéad trifluoroacetic (TFA) go minic agus is féidir é a bhaint trí scoilteacht fluairíd hidrigine (HF).
Is fluarafór é (7-Methoxycoumarin-4-il)aigéad aicéiteach (Mca) is féidir a nascadh le aimínghrúpa.
Ceanglaíonn Mca le dinitrophenyl (Dnp) le haghaidh foshraitheanna aistrithe fuinnimh athshondais fhluaraiseachta (FRET). Is é 325 nm an tonnfhad excitation, agus is é 392 nm an tonnfhad astaithe.
Is neuropeptide timthriallach é hormón meileanin-dírithe (MCH) atá scoite amach ar dtús ó iasc agus francaigh. Tá baint ag MCH go príomha le lí an chraiceann a rialú in éisc theleost agus le hiompraíocht chothaithe i mamaigh.
Tá baint ag Methyl, an t-ionadaí ailcile is simplí, le N-, O-, agus S-methylation, arb ionann iad agus modhnuithe buana ar an peptide.
3-Is grúpa blocála N-críochfort polach é Methoxysuccinyl, a chomhfhreagraíonn d'Asp(OMe) dí-ainmnithe, a ionchorpraítear go coitianta i bhfoshraitheanna carboxypeptidase.
Is modhnú iar-aistritheach (PTM) de pheptídí agus próitéiní é meitiliú ina gcuirtear grúpa meitile (-CH3) go heinsímeach le hiarmhair aimínaigéad ar leith, go coitianta lísín (Lys), arginine (Arg), histidine (His), nó glutamáit ( Glu). Is féidir leis an modhnú seo tionchar suntasach a imirt ar fheidhm próitéine, ar chobhsaíocht, agus ar idirghníomhaíochtaí le móilíní eile, agus ar an gcaoi sin ról lárnach a bheith aige maidir le próisis cheallacha éagsúla a rialáil lena n-áirítear léiriú géine, aistriú comhartha, agus idirghníomhaíochtaí próitéine-próitéine.
Is réigiún géiniteach é an mórchoimpléasc histo-chomhoiriúnachta (MHC) ina bhfuil géinte a ionchódaíonn móilíní MHC. Tá ról ríthábhachtach ag na móilíní seo sa chóras imdhíonachta agus in autoimmunity. I ndaoine, tugtar an córas antigen leukocyte daonna (HLA) ar an gcoimpléasc seo freisin.
Is próitéiní iad móilíní MHC aicme I (MHC I) ar dhromchlaí cille a chuireann peiptídí i láthair ón taobh istigh den chill go cealla T cíteatocsaineacha. Cuidíonn sé seo le cealla imdhíonachta cealla ionfhabhtaithe nó neamhghnácha a aithint agus a scriosadh, atá ríthábhachtach le haghaidh cosanta imdhíonachta i gcoinne pataiginí agus ailse.
Is próitéiní dromchla cille iad móilíní MHC aicme II (MHC II) a chuireann peptídí a dhíorthaítear ó shubstaintí eachtracha chuig cealla T cabhrach. Tá an idirghníomhaíocht seo riachtanach chun freagairtí imdhíonachta a chomhordú agus chun cealla imdhíonachta eile a ghníomhachtú i gcoinne pataiginí.
Arginín mona-mheitiolaithe
Is modhnú iar-aistritheach é arginín monomethylated (MMA) ina gcuirtear grúpa amháin meitile (-CH3) go heinsímeach le nítrigin guanidino d'iarmhar arginine laistigh de pheptíd nó próitéin.
3-mercaptopropylamine, is féidir é a úsáid mar ligand peptíde nó mar mhodhnóir i bhfeidhmeanna bithcheimiceacha agus bithleighis éagsúla.
Próiseas modhnaithe lipid is ea myristoylation ina bhfuil grúpa miristoyl, comhdhéanta d'aigéad sailleach sáithithe carbóin 14-, nasctha go comhfhiúsach le N-foirceann peiptíde. Feidhmíonn an modhnú seo chun an phróitéin a dhaingniú don chillscannán, rud a éascaíonn a logánú agus a rannpháirtíocht i bpróisis cheallacha éagsúla.
-(1-naftail)-L-alanín is díorthach aimínaigéad neamhpolar cosúil le feiniolalainín, ach le grúpa naftail in ionad grúpa feinile.
-(2-Is díorthach aimínaigéad neamhpholach é naitile)alanín cosúil le feiniolalainín, ach le grúpa naftail in ionad grúpa feinile.
De ghnáth tugtar 3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-dé-asóil (NBD) isteach tríd an imoibrí NBD-Cl a chomhchuingeach leis an peiptíd. Roghnaítear peptides lipéadaithe NBD go forleathan as a n-áisiúlacht i staidéir a dhíríonn ar sheicní agus ar bhitheolaíocht na gceall.
Is féidir N-eitilamide a mheas mar fhoirm dícarboxylated de alanine C-críochfort. I buserelin agonist LHRH, feidhmíonn NHEt mar analóg de C-c-críochfort glycinamide. Tá N-eitilamíd peptide resistant a dhíghrádú ag carboxypeptidases.
Is isastere cobhsaí de L-methionine é L-norleucine (Nle). Nuair a chuirtear gníomhaíocht bhitheolaíoch peptide i mbaol mar gheall ar fhoirmiú sulfocsaíde, is féidir Nle a chur in ionad Met gan a iompar feidhmiúil a athrú de ghnáth.
Is calator défheidhmeach é NOTA, 1,4,7-triazaicioclónán-1,4,7-aigéad triacéiteach, a fheidhmíonn mar chreat chun uirlisí íomháithe PET a thógáil. Úsáidtear é freisin i ndearadh taiscéalaithe agus i aimpliú comhartha trí éifeachtaí ilfhiúsacha agus coinnítear feidhmchláir ionchasacha mar rada-chógaisíocht ghailliam diagnóiseach.
Tagraíonn N-Me de ghnáth do N-methylation, modhnú ceimiceach ina bhfuil grúpa meitile (-CH 3 ) ceangailte le adamh nítrigine sa mhóilín, mar N-Me-Gly, N-Me-Ser, N -Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me-Val , N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, etc.
Tá NODAGA,1,4,7-triazaicioclónán,1-aigéad glútarach-4,7-aigéad diaicéiteach, ina chelator défheidhmeach den scoth le haghaidh dearadh agus forbairt rada-chógaisíochta orgánaiotalacha, ag tairiscint suntasacht poitéinseal feidhmchláir san íomháú diagnóiseach agus radaiteiripe spriocdhírithe.
2-Is grúpa cosanta S é nitrophenylthio (Nps) a úsáidtear i sintéis peiptíde soladach-chéim Boc (Boc-SPPS). Is féidir é a scoilteadh le thiols, go sonrach tríd an ngrúpa sulfhydryl saor in aisce de chistéin (Cys), rud a fhágann go gcruthófar banna disulfide go comhuaineach.
Is neuropeptide feiceálach é Neuropeptide Y (NPY) san inchinn agus mar chuid den teaghlach neuropeptide Y, a chuimsíonn polaipíd pancreatach (PP) agus peptide YY (PYY).
Is grúpa cosanta S é 2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) atá comhoiriúnach le sintéis peiptíde soladach-phas-bhunaithe Boc (Boc-SPPS). Is féidir le npys a scoilteadh ag thiols, go sonrach tríd an ngrúpa sulfhydryl saor in aisce de cistéin (Cys), a eascraíonn i foirmiú comhuaineach banna disulfide.
Is aimínaigéad alafatach neamhpholach é Norvaline agus homalóg d'aigéad -aminobutyric (Abu).
-Is fluorophore é naphthylamide a úsáidtear go coitianta i bhfoshraitheanna carboxypeptidase, a nasctar go hiondúil ag críochfort C na peptides. Cleaved NA excites ag 330 nm agus astaíonn ag 370 nm.
-Is fluorophore é naphthylamide a úsáidtear go coitianta i bhfoshraitheanna carboxypeptidase, a nasctar go hiondúil ag críochfort C na peptides. NA scoilte ag 320-340 nm, astú ag 410-420 nm.
Is grúpa cosanta carbocsail é eistear Allyl atá comhoiriúnach le sintéis peptide soladach-chéim Fmoc- agus Boc-bhunaithe (SPPS). Cosúil le Aloc, is féidir eistir aillile a bhaint go roghnach trí chóireáil le Pd(PPh3)4. In Fmoc-SPPS, tá Asp(OAall) so-ghabhálach do fhoirmiú bonn-chatalaíoch aspairtimíde.
Is féidir eistear beinsile, grúpa cosanta carbocsile, a bhaint trí hidriginiú catalaíoch (eg H2/Pd) nó aigéid láidre.
Is é OcHex an grúpa cosanta carboxyl caighdeánach a úsáidtear i sintéis peptide soladach-chéim Boc (Boc-SPPS).
Is cosaint charbocsail é 4-(N-[1(4,4-Démheitiol-2,6-dé-ocsaicicliheicilídéin)-3-eitilbúitile]aimín)eistir bhinsile (ODmab) grúpa a úsáidtear i sintéis peptide soladach-chéim bunaithe ar Fmoc (Fmoc-SPPS). Is féidir é a scoilteadh agus a dhíchosaint trí hiodráit hiodraisín 2% a úsáid i DMF.
2,4-Is grúpa cosanta carbocsaile an-lipéadaithe é eistear dimethoxybenzyl is féidir a bhaint trí úsáid a bhaint as 1% TFA i déchlóraimeatán.
Eistir eitile, Mar gheall ar na coinníollacha déine is gá chun eistir eitile a bhaint, is féidir le peptídí a mhodhnú le eistir eitile feabhas a chur ar a n-lipophilicity agus cobhsaíocht.
9-Is grúpa cosanta carbocsailile bonnlipile é an t-eistear fluorenylmethyl is féidir a bhaint trí úsáid a bhaint as piperidine i DMF.
Eistir heicsile, Mar gheall ar na coinníollacha déine is gá chun eistir eitile a bhaint, is féidir le peptídí a mhodhnú le eistir eitile feabhas a chur ar a n-lipophilicity agus cobhsaíocht.
Is aimínaigéad bacach neamhpholach é L-Otahydroindole-2-aigéad carbocsaileach (Oic). Cuireann cur isteach an aimínaigéad seo a bhaineann le proline isteach sa seicheamh polaipeiptíde isteach go mór ar chomhfhoirmiú an pheptíde.
Is grúpaí cosanta leathbhuan C-críochfort iad eistir meitile i sintéis chéim-leachtach, agus is féidir iad a thiontú ina hidrazides peptide, réamhtheachtaithe azides peptide imoibríoch. Is é cúpláil azíde an modh cúplála blúirí is coitianta i sintéis peiptíde leachta-chéim.
Is grúpa cosanta carbocsailile aigéad-labile é 3-Methylpent-3-yl eistear (OMpe) a úsáidtear go minic chun an grúpa carbocsail d'aigéad aspartach (Asp) a chosaint i sintéis peiptíde soladach-phas-bhunaithe Fmoc (Fmoc-SPPS). ). Forbraíodh an t-analóg eistear treas-bhúitile seo a bhfuil éileamh níos déine air go sonrach chun foirmiú asparagimidíde bonn-catalyzed a laghdú.
Is díorthaigh réamhghníomhaithe iad eistir Ortho-nitrophenyl de Boc- nó Z-aimínaigéid a úsáidtear i sintéis tuaslagán peptide.
Déantar Ornithine (Orn) a tháirgeadh ó arginine le linn na timthriall úiré agus is féidir é a fheiceáil freisin i peptídí mar tháirge díghrádaithe arginine. Is imoibriú taobh coiteann i sintéis peptíde é foirmiú orn trí acalú an taise guanidine arginine.
Is díorthach aimínaigéad réamhghníomhaithe é eistear hidroxysuccinimide (OSu, arna ghiorrú mar NHS) a úsáidtear go coitianta i sintéis peptíde, go háirithe modhnú peptide. Tá eistir OSu sábháilte, neamh-steric, comhoiriúnach le córais uiscí agus éasca le láimhseáil.
Eistir Tert-butyl, grúpa cosanta carboxyl aigéad-labile le haghaidh aimínaigéid i sintéis peptide.
4-aigéad aimínbheinsóch (aigéad para-aimínbesóch), Is féidir é a úsáid chun nascóirí comhchuingeacha antashubstainte-drugaí a shintéisiú. Mar shampla, is nascóir comhchuingeach drugaí antashubstainte (ADC) inscortha é Mal-PEG2-Val-Cit-PABA).
Is comhdhúil cheimiceach é PABC (para-aminobenzyl carbamate) a úsáidtear i sintéis comhchuingeacha antashubstainte-drugaí (ADCs) mar nascóir. Éascaíonn sé ceangaltán drugaí le antasubstaintí ar bhealach rialaithe, rud a éascaíonn seachadadh spriocdhírithe drugaí i dteiripí ailse agus feidhmeanna bithleighis eile. Mar shampla, is nascóir insroichte cathepsin é Mc-Val-Cit-PABC-PNP a úsáidtear i gcomhchuingeacha antashubstainte-drugaí (ADCs).
Is neuropeptide an-chaomhnaithe é an pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (PACAP) atá curtha in iúl go feiceálach ar fud na hinchinne mamaigh. Feidhmíonn sé a éifeachtaí bitheolaíocha trí leibhéil AMP timthriallacha intracellular a fheabhsú trí idirghníomhaíocht gabhdóra.
Palmitoyl, grúpa acyl nonpolar a tugadh isteach ag an N-críochfort nó taobh. Breathnaíodh palmitoylation freisin mar mhodhnú iar-aistrithe ar phróitéiní.
Is roisín meitile feinilacetamide é atá deartha go sonrach do shintéis peptide soladach-chéim Boc (Boc-SPPS). Is féidir peptides atá sintéiseithe ar an roisín seo a scaoileadh le scoilteacht HF.
I gcomhchuingeacha Antashubstaintí-Drugaí (ADCs), nascann an nascóir an t-antasubstaint leis an bpálasta cíteatocsaineacha. Tá an rogha pálasta ríthábhachtach mar go gcinnfidh sé éifeachtacht agus sainiúlacht na TFCanna maidir le teiripe a sheachadadh chuig spriocfhíocháin trí mheicníochtaí scaoilte sonracha.
Is é 2,2,4,6,7-Pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl (Pbf) an grúpa cosanta guanidino is fearr a úsáidtear i sintéis peiptíde soladach-chéim atá bunaithe ar Fmoc (Fmoc-SPPS). Léiríonn sé lability aigéad beagán níos airde i gcomparáid le Pmc.
Is analóg de L-cistéin é peinicillamine arb é is sainairíonna é ionadú grúpa meitile (-CH3) le haigéad carbocsaileach (-COOH).
Is éard atá i gceist le féinthionól peptide ná nuair a shocraíonn peiptídí iad féin go nádúrtha i struchtúir ordaithe gan idirghabháil sheachtrach. tá an próiseas seo á thiomáint ag idirghníomhaíochtaí neamhchomhfhiúsacha amhail nascadh hidrigine, idirghníomhaíochtaí hidreafóbach, fórsaí leictreastatacha, agus cruachadh π-π. Is féidir le foirmiú nanastruchtúir éagsúla a bheith mar thoradh ar fhéin-chóimeáil peptide, lena n-áirítear snáithíní, sféir, leatháin agus glóthacha, a bhfuil feidhm acu in eolaíocht ábhair, biteicneolaíocht agus leigheas.
Is grúpa acyl é Phenylacetyl (Phenylac nó Phac) atá nasctha go hiondúil ag críochfort N na peptides, arb iad is sainairíonna é polaraíocht níos ísle i gcomparáid le haicéitil (Ac). Is modhnú buan ar pheptídí é.
díorthach aimínaigéad is ea feinilglycine (Phg) ina n-ionadaíonn grúpa feanile an adamh hidrigine sa mhóilín glicín
Peptide Histidine Isoleucine (PHI), peptide muc a bhaineann le VIP agus secretin.
Meitiainín histidine peptide (PHM), peptide daonna a bhaineann le VIP.
Sainmhínítear an pointe isleictreach (pI) mar an leibhéal pH ag a bhfuil glanmhuirear nialasach ag an bpróitéin/peiptíd (Smoluch et al., 2016).
2,2,5,7,8-Pentamethylchroman-6-Is grúpa cosanta guanidinil é sulfónil (Pmc) a úsáidtear go coitianta i sintéis peiptíde soladach-chéim atá bunaithe ar Fmoc (Fmoc-SPPS). Tugtar faoi deara é a bheith beagán níos lú aigéad-labile i gcomparáid le Pbf.
Tá p-Nitroaniline, crómafór, comhchuingeach go hiondúil le C-críochfort foshraitheanna carboxypeptidase. Déantar ionsú an p-nitroaniline liberated a thomhas go coitianta ag tonnfhaid timpeall 405 nó 410 nm.
Déantar L-Propargylglycine (Pra) a tháirgeadh ag miocrorgánaigh. Tá an-mheas ar an aimínaigéad seo, arb é is sainairíonna é a struchtúr trí-bhannaí, mar aonad bunúsach chun peiptídí a shintéisiú atá in ann dul i mbun imoibrithe "cliceáil ar cheimic", rud a tharraing aird shuntasach sa réimse.
Is hormón peptide é hormone parathyroid (PTH) a scaoileann na faireoga parathyroid, ríthábhachtach chun homeostasis cailciam agus fosfar a chothabháil sa sreabhach extracellular.
Cuireann modhnuithe iar-aistrithe (PTManna) ar phróitéiní le grúpaí feidhme nó próitéiní, gearrann siad fo-aonaid rialála, nó briseann siad síos próitéiní iomlána. Cuireann na hathruithe seo, cosúil le fosfarylation, glycosylation, methylation, acetylation, lipidation, ubiquitination, nitrosylation, agus próitéalú, isteach ar an gcaoi a n-oibríonn cealla de ghnáth agus le linn galair. Tá sé ríthábhachtach PTManna a thuiscint le haghaidh taighde bunúsach agus chun cóireálacha nua a aimsiú.
aigéad piroglutamic, ar a dtugtar freisin le giorrúcháin mar Pgl, Glp, pGlu, nó
Is grúpa crómafórach N-chosanta é feinylazobenzylmethoxycarbonyl a úsáidtear i sintéis peptide, atá inbhainte ag hidriginiú catalaíoch nó aigéad láidir. Taispeánann sé uas-thonnfhad ionsú ag 229 nm, 320 nm, agus 441 nm.
Is éard atá i bpéire múchadh ná móilín fluaraiseachta (fluarafór) agus móilín quencher a úsáidtear i dtaighde agus i dtástálacha fluaraiseachta-bhunaithe. Súnn an múchadh an solas a astaíonn an fluarafór, ag laghdú a fhluaraiseachta. Nuair a bhíonn an fluorophore agus an múchadh scartha, mar shampla trí imoibriú bithcheimiceach, méadaíonn an comhartha fluaraiseachta. Ligeann sé seo do thaighdeoirí athruithe agus idirghníomhaíochtaí fíor-ama a thomhas. Úsáidtear an teicníocht seo go coitianta in iarratais ar nós PCR fíor-ama, tóireadóirí móilíneacha, agus measúnachtaí FRET (Förster Resonance Energy Transfer).
Is radaigand é fluairín-18 a úsáidtear go coitianta in íomháú PET chun meitibileacht glúcóis i bhfíocháin a mheas agus a úsáidtear go coitianta i ndiagnóisiú ailse agus íomháú inchinne.
Leabharlann peptide randamach
Is éard atá i leabharlann peptide randamach ná bailiúchán de go leor seicheamh gearr peptide a ghintear go randamach. Tá líon sonrach aimínaigéid ag gach peptide sa leabharlann le seichimh a chinntear go randamach, rud a chruthaíonn raon éagsúil de mhóilíní peptide. Úsáideann taighdeoirí na leabharlanna seo chun scagadh a dhéanamh le haghaidh peiptídí a bhfuil airíonna sonracha acu, gníomhaíochtaí bitheolaíocha, nó idirghníomhaíochtaí le sprioc-mhóilíní. Tá siad thar a bheith úsáideach maidir le fionnachtain drugaí, imdhíoneolaíocht, agus staidéir ar idirghníomhaíochtaí próitéine-próitéine, ag cuidiú le teiripí nua a aithint agus próisis chasta bhitheolaíocha a thuiscint.
Is aimínaigéad aonair é iarmhar laistigh de pheptíd nó próitéin. De réir mar a théann aimínaigéid le chéile trí bhannaí peiptíde chun na slabhraí seo a fhoirmiú, tugtar iarmhar ar gach aonad aimínaigéad. Úsáidtear an téarma seo toisc go gcailleann gach aimínaigéad móilín uisce (H2O) le linn an bhanna peptide a fhoirmiú, rud a fhágann taobh thiar de rud ar a dtugtar iarmhar.
Is polaiméir dothuaslagtha é roisín a úsáidtear i sintéis peptide soladach-chéim (SPPS) mar thacaíocht dhaingean chun aimínaigéid a chur leis go leanúnach. Soláthraíonn coirníní roisín dromchla cobhsaí agus támh a bhfuil na aimínaigéid tosaigh ceangailte go comhfhiúsach leis, rud a ligeann don slabhra peptide a thógáil iarmhar-le-iarmhar.
Is dath geal bándearg go dearg é Rhodamine B le tonnfhad excitation de ghnáth timpeall 540-570 nm agus raon solais astaithe de 560-580 nm. De ghnáth déantar é a chomhchuingeach leis an seicheamh peptíde trí ghrúpa aimín N-críochfort an pheptíde
Crómatagraf leachtach ardfheidhmíochta céim droim ar ais.
Déantar drugaí Caidrimh Struchtúr-Gníomhaíochta (SAR) a fhorbairt trí staidéar a dhéanamh ar an ngaol idir struchtúr ceimiceach druga agus a ghníomhaíocht bhitheolaíoch.
Sarcoine, an aimínaigéad N-ailcailithe is simplí.
Is féidir démheitiolarginine siméadrach (SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (siméadrach) a úsáid go díreach le haghaidh sintéis peiptídí a bhfuil démheitiolarginín siméadrach iontu.
Is modh é sintéis peptíde soladach-chéim (SPPS) chun sintéis cheimiceach peptides a dhéanamh, ina gcuirtear peptides le chéile céim ar chéim ar thaca soladach nó roisín trí aimínaigéid chosanta a chur leis go seicheamhach. Cuimsíonn SPPS dhá straitéis: Fmoc-SPPS agus Boc-SPPS, atá difriúil ó thaobh rogha na ngrúpaí cosanta N-aimín (Fmoc nó Boc) agus grúpaí cosanta slabhra taoibh. Is é an cineál grúpa cosanta N-aimín a roghnaítear a shocraíonn an straitéis cosanta slabhra taobh agus na coinníollacha maidir le scoilteacht deiridh an pheptíde ón roisín.
Is aimínaigéad neamh-próitéin é Statine, arna ghiorrú mar Sta, a úsáidtear go minic i ndearadh mimetics peptide, go háirithe i sintéis coscóirí próitéatais.
Is grúpa cosanta S é Tert-Butylthio (StBu) atá scoilte ag laghdú fosfín agus atá comhoiriúnach le Boc-SPPS.
Is modhnú N-críochfort polar é Succinyl a fhreagraíonn d'aspartate dí-aimsithe agus a ionchorpraítear go hiondúil i bhfoshraitheanna carboxypeptidase.
Is fluarafór é TAMRA, ar a ngiorraítear TMR freisin, is féidir a cheangal le aimínghrúpa. Is minic a úsáidtear é i gcomhcheangal le FAM le haghaidh foshraitheanna FRET. Tá tonnfhad excitation de 485 nm ag TAMRA agus tonnfhad astaithe 535 nm.
Is grúpa cosanta aigéad-labile é Tert-butyl a úsáidtear go coitianta le haghaidh alcóil agus feanóil, ar féidir é a scoilteadh ag baint úsáide as aigéad trifluaraicéiteach (TFA).
Is maolán é fosfáit triethylammonium a úsáidtear i gcéimeanna soghluaiste HPLC droim ar ais.
Baineadh úsáid as aigéad trifluara-aicéiteach (TFA) le haghaidh scoilteachta peiptíde ó roisín i Fmoc-SPPS agus chun grúpaí cosanta a dhíorthaítear tBu a bhaint.
Aigéad níos láidre ná TFA is ea aigéad trifluoromethansulfónach (TFMSA). Is féidir TFMSA a úsáid mar mhalairt níos sábháilte ar HF an-tocsaineach don chéim deiridh scoilte de straitéis Boc-SPPS.
Is aimínaigéad nonpolar é L-tert-leucine (Tle) le slabhraí taobh éilitheacha steiriúla a dhíchobhsaíonn -helices.
2,4,6-Is grúpa cosanta aigéad-lipéad Asn agus Gln amide a úsáidtear i Fmoc-SPPS é Trimethoxybenzyl.
Úsáidtear tosil mar ghrúpa cosanta do ghuainidín agus imidazole i Boc-SPPS, agus is féidir é a bhaint ag Na/NH3
Is grúpa cosanta aigéad-labile é Trityl (Trt) atá fostaithe le haghaidh Asn, Cys, Gln, agus a chuid iarmhair in Fmoc-SPPS. Is féidir é a bhaint go roghnach ag baint úsáide as aigéad trifluoroacetic (TFA).
De ghnáth bíonn peiptídí íon i stát púdar bán tar éis reo-thriomú.
Is peptide aimínaigéad 28- é peptide stéigeach soithíoch (VIP) a bhaineann leis an superteaghlach peptide glucagon-ghrelin-secretin.
9-Is grúpa cosanta aimíde aigéad-labile é Xanthydryl (Xan) a úsáidtear le haghaidh iarmhair Asn agus Gln i Boc-SPPS. Is féidir Xan a bhaint go roghnach trí úsáid a bhaint as TFA.
Nuair a bhíonn an peptide lipéadaithe le FAM fluorescein, taispeánann an púdar lyophilized cuma buí de ghnáth.
Úsáidtear Z-benzyloxycarbonyl, arna ghiorrú mar Z nó Cbz, mar ghrúpa cosanta aimín i sintéis peptide. Is féidir é a bhaint trí úsáid a bhaint as hidriginalú nó aigéid láidre mar HF néata nó HBr/aigéad aicéiteach.