Is é an fheidhm atá le grúpaí a chosaint ná grúpaí feidhmiúla sonracha a leithlisiú le linn an phróisis sintéise, iad a chosaint ó chur isteach, agus gan ach na grúpaí cosanta a bhaint tar éis imoibrithe sonracha a chríochnú chun gníomhaíocht an mhóilín sprioc a athbhunú. De ghnáth teastaíonn coinníollacha éadroma sa phróiseas chun grúpaí cosanta a bhaint chun damáiste a sheachaint don sprioc-mhóilín. Mar shampla, is gnách gurb é an modh chun ROH a bhaint as alcóil chosanta ná éitear (ROR ') nó eistir (ROCOR') a tháirgeadh, agus ansin iad a hidrealú nó a aigéadú faoi choinníollacha cuí.
Go hachomair, tá ról na ngrúpaí cosanta i sintéis PNA ríthábhachtach, toisc go n-áirithíonn sé sintéis éifeachtach móilíní casta, seachnaíonn sé frithghníomhartha neamh-sprioc, agus is féidir é a bhaint go roghnach nuair is gá chun táirgí PNA íonaithe a fháil.